Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrcc1Q69ZB0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms