Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms