Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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