Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P20040 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P20040 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P20040 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
P20040 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P20040 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P20040 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms