Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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NelfeP19426 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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NelfeP19426 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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NelfeP19426 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NelfeP19426 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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