Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxb1P17919 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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