Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms