Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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H2-Eb1P04230 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb1P04230 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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