Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp12O08736 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp12O08736 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp12O08736 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp12O08736 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms