Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms