Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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