Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms