Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CHD4Q14839 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CHD4Q14839 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CHD4Q14839 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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CHD4Q14839 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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