Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms