Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFHR1Q03591 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms