Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms