Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sdc1P18828 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms