Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSD2O96028 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSD2O96028 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSD2O96028 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms