Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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