Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms