Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms