Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms