Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms