Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Tmed9Q99KF1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Tmed9Q99KF1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed9Q99KF1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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