Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms