Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sde2Q8K1J5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms