Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rdh13Q8CEE7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rdh13Q8CEE7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rdh13Q8CEE7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rdh13Q8CEE7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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