Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP1B1Q10567 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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