Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf9Q07105 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms