Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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