Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PcnaP17918 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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