Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ssxb8B1AY40 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ssxb8B1AY40 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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