Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms