Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ap3b2Q9JME5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ap3b2Q9JME5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms