Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Chchd2Q9D1L0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Chchd2Q9D1L0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Chchd2Q9D1L0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms