Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms