Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp20Q8C6M1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp20Q8C6M1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp20Q8C6M1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp20Q8C6M1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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