Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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