Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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