Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoc2Q05020 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoc2Q05020 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoc2Q05020 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoc2Q05020 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms