Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps11P62281 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps11P62281 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms