Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms