Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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