Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSR4P51571 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSR4P51571 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSR4P51571 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSR4P51571 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSR4P51571 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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