Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms