Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Becn2P0DM65 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms