Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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