Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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