Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms