Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D2Q9NY47 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms